肺癌患者為什么要做基因檢測(cè)?如何進(jìn)行基因檢測(cè)?結(jié)合2022年中國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(CSCO)指南[2]和非小細(xì)胞肺癌分子病理檢測(cè)臨床實(shí)踐指南(2021 版)[3]的相關(guān)推薦,小編帶您一探究竟!
肺癌患者為什么要進(jìn)行基因檢測(cè)?
近十年來,NSCLC的治療,尤其是耙向治療,取得了極大的進(jìn)展,可明顯提高患者治療的客觀緩解率(ORR),延長(zhǎng)患者的無進(jìn)展生存期(PFS),并顯著提高患者的生活質(zhì)量(QoL)。而分子分型是NSCLC實(shí)施靶向治療的前提[3]。
研究數(shù)據(jù)表明,我國(guó)肺腺癌患者的常見驅(qū)動(dòng)基因包括表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR,45%~ 55%)、KRAS(8%~10%)、間變性淋巴瘤激酶(ALK,5%~10%)、少見驅(qū)動(dòng)基因包括ROS1(2%~3%)、 MET(2%~4%) 、HER2(2%~4%)、BRAF(1%~2%)、RET(1%~4%)、罕見驅(qū)動(dòng)基因包括NTRK(<1%)、NRG1/2(<1%)、FGFR2(<1%)等;與西方人群存在較大差異[3]。因此,選擇準(zhǔn)確、快速、恰當(dāng)?shù)臋z測(cè)方法,全面篩選出適用靶向藥物的目標(biāo)人群具有重要臨床意義。此外,隨著少見基因變異的不斷發(fā)現(xiàn)以及靶向藥物獲得性耐藥機(jī)制的完善,基因檢測(cè)有助于肺癌患者耐藥后的治療選擇[3]。
那么,基因檢測(cè)適用于哪些肺癌患者?
肺癌基因檢測(cè)適用人群、檢測(cè)時(shí)機(jī)和檢測(cè)靶點(diǎn)
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肺癌基因檢測(cè)的適用人群[2]:
2022 CSCO指南推薦可手術(shù)的Ⅰ~Ⅲ期NSCLC患者和不可手術(shù)的Ⅲ~Ⅳ期NSCLC患者進(jìn)行基因檢測(cè)。
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肺癌基因檢測(cè)的檢測(cè)時(shí)機(jī)和檢測(cè)靶點(diǎn)[2]:
對(duì)于可手術(shù)的Ⅰ~Ⅲ期NSCLC患者,2022 CSCO指南推薦術(shù)后Ⅱ/Ⅲ期非鱗癌進(jìn)行EGFR突變檢測(cè),以指導(dǎo)輔助靶向治療(Ⅰ級(jí)推薦)。
對(duì)于不可手術(shù)的Ⅲ~Ⅳ期NSCLC患者,2022 CSCO指南推薦靶向治療前或治療過程中進(jìn)行基因檢測(cè):
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病理學(xué)診斷后保留足夠組織標(biāo)本進(jìn)行分子檢測(cè),根據(jù)分子分型指導(dǎo)治療(1類):對(duì)于非鱗癌組織標(biāo)本進(jìn)行EGFR突變,ALK融合、ROS1、RET融合及MET14外顯子跳躍突變檢測(cè)(3類)(Ⅰ級(jí)推薦);
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BRAF V600E突變、KRAS突變、ERBB2(HER2)擴(kuò)增/突變,MET擴(kuò)增以及NTRK融合等基因變異可通過單基因檢測(cè)技術(shù)或二代測(cè)序技術(shù)(NGS)在腫瘤組織中進(jìn)行,若組織標(biāo)本不可及,可考慮利用游離/腫瘤DNA(cf/ctDNA進(jìn))行檢測(cè)(2B類)(Ⅱ級(jí)推薦);
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腫瘤標(biāo)本無法獲取或量少不能行基因檢測(cè)時(shí),可通過外周血cf/ctDNA進(jìn)行EGFR突變檢測(cè)(Ⅰ級(jí)推薦);
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不吸煙、經(jīng)小標(biāo)本活檢診斷鱗癌或混合腺癌成分的患者建議EGFR突變、ALK融合及ROSI融合等檢測(cè)(2A類)(Ⅱ級(jí)推薦);
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一/二代EGFR-TKIs耐藥患者,建議再次活檢進(jìn)行EGFR T790M檢測(cè)。不能獲取腫瘤標(biāo)本的患者,建議行cf/ctDNA進(jìn) EGFR T790M檢測(cè)(Ⅰ級(jí)推薦)。
肺癌基因檢測(cè)方法包括哪些?需要注意什么?咱們接著往下看!
肺癌基因檢測(cè)的方法和注意事項(xiàng)
NSCLC常見的分子病理檢測(cè)方法包括Sanger測(cè)序、熒光原位雜交(FISH)、實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)、免疫組化(IHC)、NGS等,上述檢測(cè)方法在EGFR、ALK、ROS1等靶點(diǎn)的臨床檢測(cè)中發(fā)揮著重要作用[3]。
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EGFR靶點(diǎn)的檢測(cè)方法和注意事項(xiàng)[3]:
目前EGFR基因突變檢測(cè)的方法有很多種,臨床常用的檢測(cè)方法包括 Sanger測(cè)序法、qRT-PCR法和NGS等。但需要注意的是:
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對(duì)于傳統(tǒng)方法檢測(cè)的驅(qū)動(dòng)基因陰性晚期肺腺癌患者,推薦進(jìn)行NGS檢測(cè)。
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對(duì)于一、二代EGFR-TKI耐藥患者,優(yōu)先推薦進(jìn)行T790M檢測(cè)(qRT-PCR或NGS)。也可同時(shí)與其他耐藥機(jī)制進(jìn)行檢測(cè)或T790M檢測(cè)陰性后用NGS進(jìn)行其他耐藥機(jī)制的檢測(cè)。三代TKI耐藥患者,推薦進(jìn)行NGS檢測(cè)耐藥機(jī)制。
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ALK靶點(diǎn)的檢測(cè)方法和注意事項(xiàng)[3]:
由ALK基因重排所導(dǎo)致的ALK融合基因表達(dá)可以在多個(gè)分子水平上進(jìn)行檢測(cè),包括:FISH在DNA水平上檢測(cè)ALK基因重排;qRT-PCR檢測(cè)ALK融合mRNA;IHC檢測(cè)ALK融合蛋白表達(dá),以及NGS檢測(cè)DNA水平上的重排序列或mRNA水平上的融合序列。但需要注意的是:
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在進(jìn)行IHC-Ventana D5F3、FISH、qRT-PCR及NGS檢測(cè)結(jié)果判讀時(shí),對(duì)于檢測(cè)結(jié)果不能確定、信號(hào)不典型或者位于臨界值的患者,應(yīng)建議使用其他技術(shù)平臺(tái)進(jìn)行檢測(cè)。
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優(yōu)先應(yīng)用IHC- Ventana D5F3進(jìn)行ALK檢測(cè)。當(dāng)懷疑檢測(cè)標(biāo)本有質(zhì)量問題時(shí),優(yōu)先應(yīng)用FISH檢測(cè)。當(dāng)和其他基因(如EGFR、ROS1等)一起檢測(cè)時(shí),可以進(jìn)行qRT-PCR或NGS檢測(cè)。
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ROS1靶點(diǎn)的檢測(cè)方法和注意事項(xiàng)[3]:
基于qRT-PCR方法的ROS1融合基因檢測(cè)具有較高的靈敏度和特異度,且可與ALK聯(lián)檢;FISH檢測(cè)是檢測(cè)ROS1重排的“金標(biāo)準(zhǔn)”;NGS檢測(cè)ROS1基因變異同樣可在DNA水平上檢測(cè)重排序列,也可在mRNA水平檢測(cè)融合序列。但需要注意的是:
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IHC檢測(cè)ROS1蛋白表達(dá)用于初篩ROS1融合臨床應(yīng)用前,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)經(jīng)過嚴(yán)格的檢測(cè)流程、判讀標(biāo)準(zhǔn)、質(zhì)量控制和保證,陽性病例需經(jīng)過其他技術(shù)平臺(tái)進(jìn)行驗(yàn)證。
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在進(jìn)行FISH、qRT-PCR及NGS檢測(cè)結(jié)果判讀時(shí),對(duì)于檢測(cè)結(jié)果不能確定、信號(hào)不典型或者位于臨界值的患者,應(yīng)建議使用其他技術(shù)平臺(tái)進(jìn)行檢測(cè)。
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當(dāng)和其他基因(如EGFR、ALK等)一起檢測(cè)時(shí),可以進(jìn)行qRT-PCR或NGS檢測(cè)。
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MET靶點(diǎn)的檢測(cè)方法和注意事項(xiàng)[3]:
MET 14號(hào)外顯子跳躍突變的檢測(cè)包括NGS或qRT-PCR直接檢測(cè)缺失MET 14號(hào)外顯子的mRNA,或NGS在DNA水平上檢測(cè)可能導(dǎo)致MET 14號(hào)外顯子剪切的基因變異。但需要注意的是:
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在臨床實(shí)踐中,MET 14號(hào)外顯子跳躍突變的檢測(cè),可與其他驅(qū)動(dòng)基因變異同時(shí)檢測(cè),或?qū)ζ渌?qū)動(dòng)基因變異陰性的患者進(jìn)行單獨(dú)檢測(cè)。
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應(yīng)根據(jù)可及的檢測(cè)平臺(tái)、標(biāo)本質(zhì)量及標(biāo)本類型,合理選擇不同的檢測(cè)方法。
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可參考其他融合基因檢測(cè)策略。當(dāng)組織標(biāo)本不可及時(shí),血漿標(biāo)本也可以考慮用于MET 14號(hào)外顯子跳躍突變的檢測(cè),作為補(bǔ)充。
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其他靶點(diǎn)的檢測(cè)方法和注意事項(xiàng)[3]:
HER2、BRAF、KRAS、RET、NTRK等的檢測(cè)方法可參照基因點(diǎn)突變 、基因重排類型的檢測(cè)方法和檢測(cè)策略,當(dāng)仍需進(jìn)一步積累臨床實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)。
綜上所述,NSCLC患者在治療前或治療過程中都應(yīng)進(jìn)行基因檢測(cè),以指導(dǎo)治療決策。NSCLC常見的分子病理檢測(cè)方法包括Sanger測(cè)序、FISH、qRT-PCR、IHC、NGS等,但所有分子病理檢測(cè)方法均具有優(yōu)缺點(diǎn),也受所檢基因變異類型和數(shù)量、標(biāo)本類型、標(biāo)本數(shù)量和質(zhì)量、實(shí)驗(yàn)室條件等影響,醫(yī)生會(huì)根據(jù)實(shí)際情況選擇適合患者的分子病理檢測(cè)方法,進(jìn)而根據(jù)檢測(cè)結(jié)果指導(dǎo)患者接受相應(yīng)的靶向藥物治療。
參考文獻(xiàn):
[1]. Li T, et al. J Clin Oncol. 2013 Mar 10;31(8):1039-49.
[2].中國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(CSCO)非小細(xì)胞肺癌診療指南.2022版.
[3].非小細(xì)胞肺癌分子病理檢測(cè)臨床實(shí)踐指南(2021版)[J]. 中華病理學(xué)雜志,2021,04:323-332.