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科學(xué)家利用新型技術(shù)繪制基因圖譜 有望改善癌癥診斷
時(shí)間:2017-07-06 09:41:56 來(lái)源:生物谷 點(diǎn)擊:
基因組結(jié)構(gòu)的大規(guī)模改變通常在癌細(xì)胞中比較常見(jiàn),近日來(lái)自英國(guó)巴布拉漢研究所(Babraham Institute)的研究人員通過(guò)研究就發(fā)現(xiàn)了一種能夠檢測(cè)這些改變的新方法,相關(guān)研究刊登于國(guó)際雜志Genome Biology上,該研究或?yàn)楹笃谘芯咳藛T開(kāi)發(fā)增強(qiáng)癌癥診斷的新方法及癌癥新型靶向療法提供新的思路和希望。

圖片來(lái)源:Babraham Institute

這篇研究報(bào)告中,研究者描述了一種名為Hi-C技術(shù)的新應(yīng)用,這種技術(shù)能夠幫助研究人員繪制出遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)部的排列方式和機(jī)制,通過(guò)對(duì)相關(guān)信息進(jìn)行分析,研究人員就能夠可靠地鑒別出其它方法可能會(huì)錯(cuò)過(guò)的一些主要的遺傳改變,相比標(biāo)準(zhǔn)的DNA測(cè)序方法而言,這種方法的成本較低。

Hi-C能夠?qū)θ旧w的重排進(jìn)行檢測(cè),染色體重排,即大片段DNA發(fā)生交換或者在染色體的片段間移動(dòng);同時(shí)這種技術(shù)還能夠?qū)截悢?shù)變異進(jìn)行檢測(cè),即遺傳物質(zhì)的拷貝或剔除情況,所有這些改變都會(huì)對(duì)細(xì)胞的行為產(chǎn)生劇烈的影響。研究者Louise Harewood博士表示,在一般人群和大部分癌癥患者中我們都能夠看到染色體的重排現(xiàn)象,對(duì)患者機(jī)體的染色體重排進(jìn)行檢測(cè)往往非常麻煩,而且有時(shí)候很容易錯(cuò)過(guò),當(dāng)然這或許是非常不利的,尤其是在腫瘤學(xué)領(lǐng)域中,因?yàn)槿旧w重排往往扮演著診斷和患者預(yù)后的角色。

研究者Peter Fraser教授指出,這項(xiàng)研究中,我們對(duì)6名腦瘤患者的腫瘤組織進(jìn)行分析,利用Hi-C技術(shù)對(duì)癌細(xì)胞的基因組進(jìn)行了檢測(cè),最終鑒別出了主要的基因組改變;未來(lái)這種方法或許就能夠幫助醫(yī)生和科學(xué)家們?cè)谌蚪M的廣泛背景下研究遺傳改變,Hi-C技術(shù)也將會(huì)成為一種強(qiáng)有力的工具幫助理解多種癌癥中復(fù)雜的遺傳改變。

最后,研究者表示,Hi-C技術(shù)在檢測(cè)染色體異常上扮演著關(guān)鍵角色,而且其還能夠幫助發(fā)現(xiàn)基因組中的新型融合基因,相比當(dāng)前技術(shù)而言,該技術(shù)還能夠?qū)|(zhì)量較低的樣本進(jìn)行檢測(cè),同時(shí)也能夠通過(guò)相同的數(shù)據(jù)提供拷貝相同的信息,相比當(dāng)前使用的DNA測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)方法而言,這種新技術(shù)的成本將會(huì)大大降低。

原始出處:

Louise Harewood, Kamal Kishore, Matthew D. Eldridge, et al. Hi-C as a tool for precise detection and characterisation of chromosomal rearrangements and copy number variation in human tumours. Genome Biology, 2017, DOI: 10.1186/s13059-017-1253-8

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