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面對復(fù)雜多變的癌癥基因檢測市場,臨床學(xué)家該何去何從?
時間:2017-06-15 09:46:28 來源:測序中國 點擊:

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在剛剛結(jié)束不久的ASCO年會上,眾多科研機構(gòu)及企業(yè)發(fā)布了眾多令人欣喜的抗癌新成果。作為全球性的學(xué)術(shù)交流盛會,ASCO 代表了臨床腫瘤診療研究的最高水平,在本次大會上,大部分參會者及演講嘉賓都對分子檢測和精準(zhǔn)醫(yī)療表示了認(rèn)可,他們認(rèn)為,精準(zhǔn)醫(yī)療已在癌癥醫(yī)療領(lǐng)域的實踐中達(dá)到了一個嶄新的成熟階段。

但是,隨著基因檢測在臨床及商業(yè)應(yīng)用中日益復(fù)雜的形勢,對于臨床醫(yī)生,這一嶄新的領(lǐng)域仍然是一個巨大挑戰(zhàn),眾多腫瘤學(xué)家也在ASCO的會議中討論了當(dāng)前精準(zhǔn)醫(yī)療的效用及挑戰(zhàn)。

癌癥基因組測序:臨床醫(yī)生該如何使用?

腫瘤學(xué)家Lee Schwartzburg博士談到:“目前,我們正處于癌癥基因組測序成為常規(guī)診斷方法的過渡階段,但在現(xiàn)在及將來,我們所面臨的主要問題是如何使用這些技術(shù)。”

Schwartzburg還表示,目前腫瘤學(xué)領(lǐng)域已經(jīng)出現(xiàn)了兩種觀點:一方面,醫(yī)生們認(rèn)為基因檢測非常重要,也相信該技術(shù)會成為一種標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)療手段,至少在某些領(lǐng)域會實現(xiàn);但另一方面,在個體水平上,醫(yī)生仍然不知道他們該在什么時候、以何種方式對病人進行基因檢測。

舉個例子, Medscape網(wǎng)站上個月對132名腫瘤學(xué)家進行了一項調(diào)查。結(jié)果顯示,雖然70%的腫瘤學(xué)家認(rèn)為基因組檢測是癌癥領(lǐng)域的重要突破,但是僅有30%的受訪者表示,在選擇基因組檢測時從相關(guān)機構(gòu)獲得了指導(dǎo)。

雖然大部分受調(diào)查者表示,在近一周或一個月內(nèi)對病人使用過基因組檢測,但大部分基因檢測是在標(biāo)準(zhǔn)治療方法不可行或病情惡化以及臨床試驗中進行的;此外,很多腫瘤學(xué)家還表示他們并不清楚應(yīng)該在什么情況下進行這種檢測;同時,受訪者還對檢測給病人的帶來的收益和意義有著強烈的分歧,尤其是對較為罕見的突變檢測。

肺癌分子檢測帶來啟示

但對腫瘤學(xué)的某些領(lǐng)域而言,情況會好很多。萊文癌癥研究所的腫瘤學(xué)家Edward Kim表示,例如肺癌的分子檢測就已經(jīng)被作為一種關(guān)鍵的常規(guī)檢測。

Edward Kim在會議中談道:“分子檢測對診斷和階段性的檢查是必不可少。這是必須進行的檢測,而且應(yīng)該成為初期診斷的基礎(chǔ)組成部分。”

換言之,新確診的肺癌患者不應(yīng)該在沒有進行基因組檢測的情況下直接進行化療。因為基因組檢測結(jié)果可能會顯示,一些病人并不適合某種基因靶向或免疫治療藥物。

但美國達(dá)納-法伯癌癥研究所腫瘤學(xué)家Deborah Schrag也表示,雖然ASCO的指南和美國腫瘤治療指南推薦在初始治療前進行EGFR基因和ALK基因的生物標(biāo)志物檢測,但在社區(qū)機構(gòu)中,40%的患者并沒有進行EGFR檢測,50%的患者也沒有接受ALK基因的檢測。

此外,即使對于EGFR和ALK這些有著“頂級標(biāo)準(zhǔn)”的基因測試,臨床醫(yī)生仍然不知道應(yīng)該選擇哪種檢測方法。例如,面對最新出現(xiàn)的血液型檢測或液體活檢技術(shù),以及EGFR耐藥性突變,這些都成為了肺癌醫(yī)生面臨的新挑戰(zhàn)。

去年六月,羅氏公司基于PCR的 Cobas EGFR Mutation Test v2已經(jīng)獲批作為基因泰克公司Tarceva (erlotinib)藥物的伴隨診斷,F(xiàn)DA在九月份擴大了檢測的適用范圍,增加了一項作為非小型細(xì)胞肺癌患者在接受阿斯利康公司的Tagrisso (osimertinib)藥物治療時的伴隨診斷。

但是其他公司為了相同的目的也提供了實驗室自建試劑方法(LDTs),且有些方法的敏感度更高。

Kim表示,在萊文癌癥研究所內(nèi),肺癌領(lǐng)域的從業(yè)醫(yī)生遵守了一種關(guān)于明確定義的方法,以判斷進行基因檢測的時間和方式。例如,研究所會將組織樣本會送去Caris Life Sciences公司;對于最近興起的血液型檢測方法(液態(tài)活檢技術(shù)),研究所則選擇了Inivata公司。

初期診斷之外的情況則更為復(fù)雜,甚至可以用“一片泥濘”形容,而實踐的標(biāo)準(zhǔn)化可以說幾乎是無法實現(xiàn)的。

Schrag舉了一個例子,一名中年男性患者患有局部晚期而且不可切除的胰腺癌。“胰腺癌并不是精準(zhǔn)醫(yī)療應(yīng)用的典型代表,而且也不是任何技術(shù)應(yīng)用的典型代表。”當(dāng)放療和化療都無法使其腫瘤縮小到可以進行手術(shù)切除后,這名患者向一家商業(yè)實驗室尋求了全面的基因組檢測,并最終檢測到ALK基因變異。之后患者回到腫瘤醫(yī)生那里,并要求服用未得到臨床認(rèn)可的藥物克唑替尼。

Schrag在會上問道:“你會怎么做?咨詢腫瘤委員還是查找文獻?或進行臨床試驗?還是直接開藥?……”

她補充說,文獻中積極的報道可以幫助我們對未得到臨床認(rèn)可的藥物進行用藥決策。但是,懷疑者也可能會說,此前曾受到過這些信息的誤導(dǎo)。例如,威羅非尼對攜帶有BRAF突變的黑色素瘤有效,但是在攜帶有BRAF突變的結(jié)直腸癌中卻沒有作用。”

Schrag強調(diào):“這是都是真實且日益普遍的現(xiàn)象,這代表著我們?nèi)粘5哪[瘤治療實踐。”

效用及經(jīng)濟問題日漸突出

另一方面,商業(yè)檢測的復(fù)雜性日益增長,也帶來了效用和經(jīng)濟方面的問題,但腫瘤領(lǐng)域還不具有同等的處理能力。

Schwartzburg認(rèn)為,測序的成本至今已經(jīng)下降了,放棄綜合panel而選擇單基因測試的經(jīng)濟學(xué)論據(jù)很少,因為陰性結(jié)果進一步測試的成本快速超過了從一開始就選擇綜合panel的價格。

但是Schrag也表示,費用的效用并不能完全按照這樣的推理思路,因此考慮使用綜合的還是范圍較窄的檢測對醫(yī)生來說仍然是不小的挑戰(zhàn)。

在會議最后的問答環(huán)節(jié)中,提問者主要關(guān)注的問題是目前行業(yè)缺乏一致標(biāo)準(zhǔn)或統(tǒng)一性,因為市場上有太多不同的綜合性測序產(chǎn)品可以選擇

Kim對此表示贊同:“精準(zhǔn)醫(yī)療帶來的改變的確是發(fā)人深省的問題,而且基因panel和綜合性檢測的數(shù)量確實多到令人生畏。”

Schwartzburg也表示,參會者應(yīng)該意識到,基因組檢測與傳統(tǒng)的實驗室分析是不同的。而對于傳統(tǒng)的實驗室檢測,在不同供應(yīng)商間進行同種檢測可以預(yù)期得到相同的結(jié)果。腫瘤學(xué)家應(yīng)該主動去解讀綜合性panel的報告結(jié)果,然后評估測序深度等信息,這可能是不同公司間對于同組基因檢測報告結(jié)果出現(xiàn)差異的主要原因。

Schwartzburg強調(diào):“你需要首先了解檢測的特性,確保能夠理解所獲得的信息。”

此外,差異的來源還包括數(shù)據(jù)的解讀和變異識別。他表示,美國分子病理學(xué)等組織機構(gòu)也正在尋找解決方法。

Schrag談道,臨床腫瘤機構(gòu)真正需要的是明確的數(shù)據(jù),能夠用于證明接受全面基因組檢測并進行精準(zhǔn)治療的患者,其預(yù)后優(yōu)于未獲得這些信息的患者

可惜得是,目前這一領(lǐng)域還沒有答案。這也許解釋了人們對于基因組醫(yī)學(xué)的熱情和對其價值的懷疑。

精準(zhǔn)醫(yī)療“新趨勢”下的新挑戰(zhàn)

演講者們最后討論了該領(lǐng)域中近期的一些舉措,可能會加劇醫(yī)生們的困難,尤其是最近FDA批準(zhǔn)的不區(qū)分腫瘤來源的抗癌療法。5月23日,美國FDA批準(zhǔn)了默沙東公司的PD-1抗體Keytruda 用于治療攜帶一種特定基因特征的任何一種實體瘤。這是美國FDA批準(zhǔn)的首款不依據(jù)腫瘤來源,而是依據(jù)生物標(biāo)志物進行區(qū)分的抗腫瘤療法。

從ASCO展示的數(shù)據(jù)來看,類似的癌癥位點未知的檢測可能會持續(xù)增多并獲批,例如在TRK基因融合陽性腫瘤檢測的參與者中,有四分之三都對Loxo Oncology公司的藥物larotrectinib具有反應(yīng),無論是哪種癌癥類型。

Schrag將Keytruda的例子稱作一個分水嶺,但是她提醒道,這也無疑為臨床醫(yī)生帶來了另一些挑戰(zhàn)。她在會議中表示,“我相信很多人都接到過來自患者的電話,詢問他們的腫瘤是否具有高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定性。”

她提出,醫(yī)生可能會疑惑選擇哪種檢測。FDA雖然批準(zhǔn)了Keytruda,但卻沒有專門的伴隨診斷檢測。關(guān)于檢測人群則是一個開放的問題。弄清楚某種檢測的必要性需要了解不同癌癥類型的MSI頻率,同時Schrag也談到,目前還沒有機構(gòu)可以對此進行快速檢測。

參考資料:

Oncologists Discuss Practicalities, Challenges in Navigating Evolving Genomic Testing Market

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