ASCO2017：基因測試在癌癥治療中大有作為
時間：2017-07-04 09:44:38 來源：生物谷 點擊：
1.常規(guī)基因組測試是可行的，但僅對部分癌癥病人帶來益處
新聞來源：Routine genomic testing is feasible, but only a subset of patients benefit
對腫瘤樣品進(jìn)行基因組測試能夠進(jìn)行個人化治療選擇：靶向療法與腫瘤中的遺傳變化相匹配。盡管越來越多的晚期癌癥病人接受某種基因組測試，但是綜合性基因組測試迄今為止并不是一種常規(guī)的選擇。
根據(jù)在美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）2017年年度會議發(fā)布的研究結(jié)果，一項在法國針對1944名晚期癌癥（包括結(jié)直腸癌、婦科癌癥、乳腺癌、腦癌、頭頸癌和肉瘤）病人開展的研究提示著廣泛的常規(guī)性基因組測試是可行的，不過它僅對一部分病人提供臨床上的益處。根據(jù)研究人員的說法，這是此類研究中最大的一項。
這些研究人員發(fā)現(xiàn)至少一種“可靶向（actionable）”突變（在理論上，這些突變是能夠與靶向療法相匹配的基因變化）存在于52%的接受測試的癌癥病人（1004人）中：609人僅攜帶一種可靶向突變，394人攜帶兩種或以上可靶向突變（最高達(dá)6種），最常見的可靶向通路是PI3K/mTOR通路。一個分子腫瘤董事會給676名病人推薦靶向療法，而且其中的143人接受這種推薦療法。接受這種推薦療法的病人的五年生存率高于那些未接受這種療法的病人（前者的五年生存率為34.8%，后者的為28.1%）。
2.新型血液檢測能夠在癥狀出現(xiàn)前預(yù)測癌癥
新聞來源：Novel sequencing approach seeks to detect cancer's genomic alterations
最近一項無創(chuàng)性的癌癥診斷前期試驗效果顯著，這一新突破有助于未來高精度癌癥血液診斷與篩查技術(shù)的提高。這一技術(shù)的主要原理是檢測血液中的腫瘤細(xì)胞特異性DNA，而前期的試驗結(jié)果讓我們對癌癥的診斷又邁進(jìn)了一步。
科學(xué)家們試圖尋找基于血液的檢測方法，這種方法能夠在不進(jìn)行手術(shù)的前提下進(jìn)行癌癥的診斷，不僅對患者的傷害低，而且能夠使診斷的時間大幅提前。
由于腫瘤組織中的DNA碎片會進(jìn)入血液中，即循環(huán)性腫瘤DNA（ctDNA），因此這種方法具有一定的理論基礎(chǔ)。最近，研究者們一直在尋找最佳的檢測ctDNA的方法，而在最近的一項研究中，科學(xué)家們提供了最新的進(jìn)展。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在《Journal of Clinical Oncology》雜志上。
研究者們收集了了124名患有惡性乳腺癌、肺癌以及胰腺癌的患者的血液以及組織樣本，并且通過篩查發(fā)現(xiàn)了508種不同的基因突變。為了檢測這種方法能否在血液中發(fā)現(xiàn)游離的腫瘤DNA，研究者們比較了血液樣本、癌癥組織樣本以及白血球樣本中的遺傳物質(zhì)的差異。結(jié)果顯示，所有癌癥的突變中，有73%在血液中都能夠檢測得到。
檢測ctDNA的最大好處是其出現(xiàn)時間早于腫瘤組織形成，因此及早地診斷有助于防止疾病的擴(kuò)散與惡化。
3.癌癥或可早期經(jīng)抽血得以發(fā)現(xiàn)
新聞來源：An initial step toward blood tests for early detection of cancer
在對124位晚期乳腺癌，肺癌和前列腺癌患者的研究中，一種新的高強(qiáng)度基因組測序方法以高比率檢測了循環(huán)腫瘤DNA。在89％的患者中，其血液中也檢測到至少一種在腫瘤中檢測到的遺傳變化。總體而言，這種方法在血液樣本中也發(fā)現(xiàn)腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)的627（73％）種遺傳變異。
該研究將在今天的新聞發(fā)布會上發(fā)表，并在2017年美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會上發(fā)表。
這種創(chuàng)新的方法——使用高強(qiáng)度測序來檢測血液中循環(huán)腫瘤DNA ，預(yù)示著早期癌癥檢測的未來測試的發(fā)展。
本研究中使用的高強(qiáng)度測序方法具有廣度和深度的獨特組合。它以高精度掃描基因組非常廣泛的區(qū)域（508個基因和超過200萬個堿基對或基因組字母，即A，T，C和G）（基因組的每個區(qū)域測序或“讀取” 60，000次），比其他測序方法產(chǎn)生大約多出100倍的數(shù)據(jù)。這些巨大的數(shù)據(jù)將有助于開展血液檢測以早期發(fā)現(xiàn)癌癥。
然而，這種方法不同于液體活組織檢查，包括商業(yè)測試，其僅在已經(jīng)診斷為癌癥的患者中描繪基因組的相對較小部分，以幫助監(jiān)測疾病或檢測可與可用藥物匹配的能夠通過行動作出的改變或臨床試驗。
“我們的研究結(jié)果表明，高強(qiáng)度循環(huán)腫瘤DNA測序是可能的，可能為臨床決策提供寶貴的信息，可能會不需要腫瘤組織樣品，”首席研究作者Pedram Razavi博士，醫(yī)學(xué)腫瘤學(xué)家，紐約紐約紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心（MSK）的醫(yī)學(xué)教練說道。 “這項研究也是發(fā)展早期檢測癌癥的血液檢測過程中的重要一步。”
4.對復(fù)發(fā)風(fēng)險較低的結(jié)腸癌病人而言，更短的化療療程不會降低其療效
新聞來源：Global study sets new risk-based standard to personalize chemotherapy for colon cancer
在對淋巴結(jié)陽性結(jié)腸癌（III期）進(jìn)行手術(shù)摘除后，一些病人可能僅需要將長期以來的化療標(biāo)準(zhǔn)療程減半。在一項新的研究中，通過對涉及12800名病人的6項在北美、歐洲和亞洲開展的臨床試驗進(jìn)行分析，在具有相對較低復(fù)發(fā)風(fēng)險的病人當(dāng)中，3個月的化療幾乎與6個月的化療一樣有效，并且導(dǎo)致更少的副作用（特別是神經(jīng)損傷）。這些數(shù)據(jù)將在2017年美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會上發(fā)表。
在進(jìn)行結(jié)直腸癌手術(shù)摘除后，化療會降低癌癥復(fù)發(fā)幾率。自從2004年以來，在進(jìn)行手術(shù)摘除后的標(biāo)準(zhǔn)療法是在為期6個月的化療藥物聯(lián)合治療（FOLFOX或CAPOX）。
這項研究的目標(biāo)是確定3個月的化療是否與6個月的化療那樣有效。盡管主要終點在統(tǒng)計學(xué)上未加以證實，但是相比于標(biāo)準(zhǔn)的6個月化療療程，較短的3個月療程與第3年的結(jié)腸癌未復(fù)發(fā)幾率降低將近1%相關(guān)聯(lián)（前者是74.6%，后者是75.5%）。在被認(rèn)為具有較低癌癥復(fù)發(fā)風(fēng)險的病人當(dāng)中，這一差異更?。▽邮?個月療程的病人而言是83.1%，對接受6個月療程的病人而言是83.3%）。
在這種療程中的一種化療藥物（奧沙利鉑）的一種關(guān)鍵的副作用是神經(jīng)損傷，這能夠?qū)е掠谰玫穆槟?、刺痛和疼痛。一名患者接受奧沙利鉑治療的時間更長，出現(xiàn)嚴(yán)重的持續(xù)長時間的神經(jīng)疼痛的幾率更大。接受3個月化療療程的病人產(chǎn)生的神經(jīng)疼痛要比接受6個月療程的病人顯著更不常見（對FOLFOX而言，前者是15%，后者是45%；對CAPOX而言，前者是17%，后者是48%）。
5.基因測序可能影響72%的晚期癌癥病人的治療
新聞來源：Genetic sequencing could influence treatment for nearly 3/4 of advanced cancer patients
在一項新的500名晚期癌癥病人的研究中，來自美國密歇根大學(xué)綜合癌癥中心測序計劃的研究人員發(fā)現(xiàn)將近四分之三（72%）的人基于對他們的腫瘤種的遺傳標(biāo)志物進(jìn)行的綜合分析結(jié)果具有潛在的靶向療法。該研究將在2017年美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會上發(fā)表。
這項研究提示作為一種評價腫瘤中的DNA和RNA的復(fù)雜方法，下一代測序有助指導(dǎo)治療。
6.腫瘤的突變數(shù)量隨著年齡和癌癥類型發(fā)生變化
新聞來源：Number of mutations in a tumor varies by age and type of cancer
在一項新的研究中，由來自美國佐治亞大學(xué)倫巴狄綜合癌癥中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)除了幾種其他的因素之外，在病人癌癥活組織樣品中的腫瘤突變負(fù)荷（tumor mutation load, TML）隨著年齡和癌癥類型發(fā)生變化。
這些研究人員說，這些發(fā)現(xiàn)是迄今為止涉及14種實體瘤的一些最為完整的TML分析。這項研究包括8000多種腫瘤樣品，也使得它成為為分析TML而研究過的比較大的腫瘤樣品之一。
TML衡量DNA中存在的突變數(shù)量。發(fā)生突變的DNA隨后能夠轉(zhuǎn)化為蛋白中的有害變化。發(fā)生突變的蛋白經(jīng)常對免疫系統(tǒng)似乎是外來的，因此能夠激活一種強(qiáng)健的免疫反應(yīng)，并且免疫治療試劑能夠增強(qiáng)這種免疫反應(yīng)。
佐治亞大學(xué)倫巴狄綜合癌癥中心醫(yī)學(xué)助理教授Mohamed E. Salem博士說，“我們的更令人關(guān)注的發(fā)現(xiàn)之一是在很多癌癥中，TML隨著年齡增加而增加。在我們研究過的大多數(shù)癌癥中，較大的年齡與TML密切相關(guān)聯(lián)，但是在膀胱癌等一些癌癥中，TML與年齡不存在關(guān)聯(lián)，這也成為難以治療的癌癥的一種重要的觀察指標(biāo)。”
7.在很多實體瘤中鑒定出同源重組缺陷
新聞來源：Deficiencies in repair of DNA identified in many types of solid tumors
在一項針對48000多種腫瘤樣品開展的新研究中，來自美國佐治亞大學(xué)倫巴狄綜合癌癥中心的研究人員發(fā)現(xiàn)一種旨在阻止DNA發(fā)生突變并導(dǎo)致癌癥的修復(fù)機(jī)制存在關(guān)鍵缺陷的證據(jù)。
這種被稱作同源重組缺陷（homologous recombination deficiency, HRD）的DNA修復(fù)缺陷之前已在僅幾種癌癥中研究過，但是正如這些研究人員報道的那樣，HRD能夠在他們研究的大約20種不同的實體瘤（包括前列腺癌、乳腺癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌和兩種比較致命性的癌癥：卵巢癌和神經(jīng)膠質(zhì)瘤）中發(fā)現(xiàn)到。
在48733種腫瘤樣品中，這些研究人員發(fā)現(xiàn)在11.61%的樣品中存在HRD相關(guān)的突變，其中最高的突變水平是在子宮內(nèi)膜癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤和卵巢癌中發(fā)現(xiàn)的（分別為38%、15%和12%）。他們發(fā)現(xiàn)最常發(fā)生突變的基因是ATM、PTEN、BRCA2、BRCA1和ATRX。
這些發(fā)現(xiàn)可能有助開發(fā)出治療發(fā)生HRD的癌癥的新療法。
新聞來源：Routine genomic testing is feasible, but only a subset of patients benefit
根據(jù)在美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）2017年年度會議發(fā)布的研究結(jié)果，一項在法國針對1944名晚期癌癥（包括結(jié)直腸癌、婦科癌癥、乳腺癌、腦癌、頭頸癌和肉瘤）病人開展的研究提示著廣泛的常規(guī)性基因組測試是可行的，不過它僅對一部分病人提供臨床上的益處。根據(jù)研究人員的說法，這是此類研究中最大的一項。
這些研究人員發(fā)現(xiàn)至少一種“可靶向（actionable）”突變（在理論上，這些突變是能夠與靶向療法相匹配的基因變化）存在于52%的接受測試的癌癥病人（1004人）中：609人僅攜帶一種可靶向突變，394人攜帶兩種或以上可靶向突變（最高達(dá)6種），最常見的可靶向通路是PI3K/mTOR通路。一個分子腫瘤董事會給676名病人推薦靶向療法，而且其中的143人接受這種推薦療法。接受這種推薦療法的病人的五年生存率高于那些未接受這種療法的病人（前者的五年生存率為34.8%，后者的為28.1%）。
2.新型血液檢測能夠在癥狀出現(xiàn)前預(yù)測癌癥
新聞來源：Novel sequencing approach seeks to detect cancer's genomic alterations
最近一項無創(chuàng)性的癌癥診斷前期試驗效果顯著，這一新突破有助于未來高精度癌癥血液診斷與篩查技術(shù)的提高。這一技術(shù)的主要原理是檢測血液中的腫瘤細(xì)胞特異性DNA，而前期的試驗結(jié)果讓我們對癌癥的診斷又邁進(jìn)了一步。
科學(xué)家們試圖尋找基于血液的檢測方法，這種方法能夠在不進(jìn)行手術(shù)的前提下進(jìn)行癌癥的診斷，不僅對患者的傷害低，而且能夠使診斷的時間大幅提前。
由于腫瘤組織中的DNA碎片會進(jìn)入血液中，即循環(huán)性腫瘤DNA（ctDNA），因此這種方法具有一定的理論基礎(chǔ)。最近，研究者們一直在尋找最佳的檢測ctDNA的方法，而在最近的一項研究中，科學(xué)家們提供了最新的進(jìn)展。相關(guān)結(jié)果發(fā)表在《Journal of Clinical Oncology》雜志上。
研究者們收集了了124名患有惡性乳腺癌、肺癌以及胰腺癌的患者的血液以及組織樣本，并且通過篩查發(fā)現(xiàn)了508種不同的基因突變。為了檢測這種方法能否在血液中發(fā)現(xiàn)游離的腫瘤DNA，研究者們比較了血液樣本、癌癥組織樣本以及白血球樣本中的遺傳物質(zhì)的差異。結(jié)果顯示，所有癌癥的突變中，有73%在血液中都能夠檢測得到。
檢測ctDNA的最大好處是其出現(xiàn)時間早于腫瘤組織形成，因此及早地診斷有助于防止疾病的擴(kuò)散與惡化。
3.癌癥或可早期經(jīng)抽血得以發(fā)現(xiàn)
新聞來源：An initial step toward blood tests for early detection of cancer
該研究將在今天的新聞發(fā)布會上發(fā)表，并在2017年美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會上發(fā)表。
這種創(chuàng)新的方法——使用高強(qiáng)度測序來檢測血液中循環(huán)腫瘤DNA ，預(yù)示著早期癌癥檢測的未來測試的發(fā)展。
本研究中使用的高強(qiáng)度測序方法具有廣度和深度的獨特組合。它以高精度掃描基因組非常廣泛的區(qū)域（508個基因和超過200萬個堿基對或基因組字母，即A，T，C和G）（基因組的每個區(qū)域測序或“讀取” 60，000次），比其他測序方法產(chǎn)生大約多出100倍的數(shù)據(jù)。這些巨大的數(shù)據(jù)將有助于開展血液檢測以早期發(fā)現(xiàn)癌癥。
然而，這種方法不同于液體活組織檢查，包括商業(yè)測試，其僅在已經(jīng)診斷為癌癥的患者中描繪基因組的相對較小部分，以幫助監(jiān)測疾病或檢測可與可用藥物匹配的能夠通過行動作出的改變或臨床試驗。
“我們的研究結(jié)果表明，高強(qiáng)度循環(huán)腫瘤DNA測序是可能的，可能為臨床決策提供寶貴的信息，可能會不需要腫瘤組織樣品，”首席研究作者Pedram Razavi博士，醫(yī)學(xué)腫瘤學(xué)家，紐約紐約紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心（MSK）的醫(yī)學(xué)教練說道。 “這項研究也是發(fā)展早期檢測癌癥的血液檢測過程中的重要一步。”
4.對復(fù)發(fā)風(fēng)險較低的結(jié)腸癌病人而言，更短的化療療程不會降低其療效
新聞來源：Global study sets new risk-based standard to personalize chemotherapy for colon cancer
在對淋巴結(jié)陽性結(jié)腸癌（III期）進(jìn)行手術(shù)摘除后，一些病人可能僅需要將長期以來的化療標(biāo)準(zhǔn)療程減半。在一項新的研究中，通過對涉及12800名病人的6項在北美、歐洲和亞洲開展的臨床試驗進(jìn)行分析，在具有相對較低復(fù)發(fā)風(fēng)險的病人當(dāng)中，3個月的化療幾乎與6個月的化療一樣有效，并且導(dǎo)致更少的副作用（特別是神經(jīng)損傷）。這些數(shù)據(jù)將在2017年美國臨床腫瘤學(xué)會（ASCO）年會上發(fā)表。
在進(jìn)行結(jié)直腸癌手術(shù)摘除后，化療會降低癌癥復(fù)發(fā)幾率。自從2004年以來，在進(jìn)行手術(shù)摘除后的標(biāo)準(zhǔn)療法是在為期6個月的化療藥物聯(lián)合治療（FOLFOX或CAPOX）。
這項研究的目標(biāo)是確定3個月的化療是否與6個月的化療那樣有效。盡管主要終點在統(tǒng)計學(xué)上未加以證實，但是相比于標(biāo)準(zhǔn)的6個月化療療程，較短的3個月療程與第3年的結(jié)腸癌未復(fù)發(fā)幾率降低將近1%相關(guān)聯(lián)（前者是74.6%，后者是75.5%）。在被認(rèn)為具有較低癌癥復(fù)發(fā)風(fēng)險的病人當(dāng)中，這一差異更?。▽邮?個月療程的病人而言是83.1%，對接受6個月療程的病人而言是83.3%）。
在這種療程中的一種化療藥物（奧沙利鉑）的一種關(guān)鍵的副作用是神經(jīng)損傷，這能夠?qū)е掠谰玫穆槟?、刺痛和疼痛。一名患者接受奧沙利鉑治療的時間更長，出現(xiàn)嚴(yán)重的持續(xù)長時間的神經(jīng)疼痛的幾率更大。接受3個月化療療程的病人產(chǎn)生的神經(jīng)疼痛要比接受6個月療程的病人顯著更不常見（對FOLFOX而言，前者是15%，后者是45%；對CAPOX而言，前者是17%，后者是48%）。
5.基因測序可能影響72%的晚期癌癥病人的治療
新聞來源：Genetic sequencing could influence treatment for nearly 3/4 of advanced cancer patients
這項研究提示作為一種評價腫瘤中的DNA和RNA的復(fù)雜方法，下一代測序有助指導(dǎo)治療。
6.腫瘤的突變數(shù)量隨著年齡和癌癥類型發(fā)生變化
新聞來源：Number of mutations in a tumor varies by age and type of cancer
在一項新的研究中，由來自美國佐治亞大學(xué)倫巴狄綜合癌癥中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)除了幾種其他的因素之外，在病人癌癥活組織樣品中的腫瘤突變負(fù)荷（tumor mutation load, TML）隨著年齡和癌癥類型發(fā)生變化。
這些研究人員說，這些發(fā)現(xiàn)是迄今為止涉及14種實體瘤的一些最為完整的TML分析。這項研究包括8000多種腫瘤樣品，也使得它成為為分析TML而研究過的比較大的腫瘤樣品之一。
TML衡量DNA中存在的突變數(shù)量。發(fā)生突變的DNA隨后能夠轉(zhuǎn)化為蛋白中的有害變化。發(fā)生突變的蛋白經(jīng)常對免疫系統(tǒng)似乎是外來的，因此能夠激活一種強(qiáng)健的免疫反應(yīng)，并且免疫治療試劑能夠增強(qiáng)這種免疫反應(yīng)。
佐治亞大學(xué)倫巴狄綜合癌癥中心醫(yī)學(xué)助理教授Mohamed E. Salem博士說，“我們的更令人關(guān)注的發(fā)現(xiàn)之一是在很多癌癥中，TML隨著年齡增加而增加。在我們研究過的大多數(shù)癌癥中，較大的年齡與TML密切相關(guān)聯(lián)，但是在膀胱癌等一些癌癥中，TML與年齡不存在關(guān)聯(lián)，這也成為難以治療的癌癥的一種重要的觀察指標(biāo)。”
7.在很多實體瘤中鑒定出同源重組缺陷
新聞來源：Deficiencies in repair of DNA identified in many types of solid tumors
這種被稱作同源重組缺陷（homologous recombination deficiency, HRD）的DNA修復(fù)缺陷之前已在僅幾種癌癥中研究過，但是正如這些研究人員報道的那樣，HRD能夠在他們研究的大約20種不同的實體瘤（包括前列腺癌、乳腺癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌和兩種比較致命性的癌癥：卵巢癌和神經(jīng)膠質(zhì)瘤）中發(fā)現(xiàn)到。
在48733種腫瘤樣品中，這些研究人員發(fā)現(xiàn)在11.61%的樣品中存在HRD相關(guān)的突變，其中最高的突變水平是在子宮內(nèi)膜癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤和卵巢癌中發(fā)現(xiàn)的（分別為38%、15%和12%）。他們發(fā)現(xiàn)最常發(fā)生突變的基因是ATM、PTEN、BRCA2、BRCA1和ATRX。
這些發(fā)現(xiàn)可能有助開發(fā)出治療發(fā)生HRD的癌癥的新療法。
