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華人學(xué)者Nature Methods發(fā)布單細(xì)胞測序重要工具
時(shí)間:2016-04-21 09:53:53 來源:生物探索 點(diǎn)擊:
德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個(gè)用于單細(xì)胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發(fā)表在四月十八日的Nature Methods雜志上,文章通訊作者是MD安德森癌癥中心的助理教授Ken Chen博士和Nicholas Navin。

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新一代測序技術(shù)(NGS)大大增進(jìn)了我們對疾?。ū热绨┌Y)的理解。不過NGS的研究對象是細(xì)胞群體,會(huì)掩蓋細(xì)胞之間的異質(zhì)性。正因如此,單細(xì)胞測序(SCS)技術(shù)受到了越來越多的關(guān)注。

德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個(gè)用于單細(xì)胞DNA測序的突變檢出程序,Monovar。這一重要成果發(fā)表在四月十八日的Nature Methods雜志上,文章通訊作者是MD安德森癌癥中心的助理教授Ken Chen博士和Nicholas Navin。Chen博士本科畢業(yè)于清華大學(xué),隨后在Illinois大學(xué)取得博士學(xué)位。

單細(xì)胞測序技術(shù)對許多生物學(xué)領(lǐng)域產(chǎn)生了很大的影響,包括癌癥研究、神經(jīng)生物學(xué)、微生物學(xué)和免疫學(xué),大大推動(dòng)了人們對腫瘤特性的認(rèn)識(shí)。不過研究者們一直缺乏在單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)中準(zhǔn)確檢測單核苷酸變異(SNV)的工具。“為此我們開發(fā)了Monovar,”Nicholas Navin博士說。“Monovar是一種新統(tǒng)計(jì)方法,能夠利用多個(gè)單細(xì)胞的數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)SNV。”

研究人員認(rèn)為Monovar是單細(xì)胞測序評(píng)估SNV的一大進(jìn)步,能夠?yàn)槿藗兲峁┒喾N疾病的關(guān)鍵信息。精確檢測SNV對于癌癥診療、個(gè)性化醫(yī)療和產(chǎn)前診斷非常重要,而Monovar在這些方面有著廣闊的應(yīng)用前景。

單細(xì)胞基因組學(xué)領(lǐng)域近年來發(fā)展得非常迅速,為人們揭示了復(fù)雜生物學(xué)體系的許多重要線索,包括微生物群落的生態(tài)多樣性和人類癌癥的基因組。一月二十五日Nature Reviews Genetics雜志發(fā)表的一篇重要綜述,全面介紹了單細(xì)胞基因組測序的發(fā)展現(xiàn)狀。文章的通訊作者是著名科學(xué)家、斯坦福大學(xué)生物工程系主任Stephen R. Quake。

細(xì)胞間差異和異質(zhì)性是干細(xì)胞群體固有的基本特性。如果我們對一群細(xì)胞進(jìn)行組學(xué)分析,這些關(guān)鍵的信息就會(huì)被掩蓋。單細(xì)胞測序技術(shù)可以在同種干細(xì)胞中全面剖析細(xì)胞異質(zhì)性,鑒定不同表型的細(xì)胞。北京大學(xué)的研究員湯富酬和文路在四月十五日的Genome Biology雜志上發(fā)表文章,深入淺出的介紹了干細(xì)胞生物學(xué)研究中的單細(xì)胞測序技術(shù)。


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