目前為止的大部分腫瘤基因組研究都集中在原發(fā)腫瘤上，腫瘤中新出現(xiàn)的基因突變也是選擇靶向治療方案的主要依據(jù)。而最近，來自美國密西根大學(xué)（University of Michigan）的科學(xué)家們發(fā)表了一項迄今規(guī)模最大、最全面的對于轉(zhuǎn)移腫瘤的基因組研究，其中有一些很有意思的新發(fā)現(xiàn)，這項研究發(fā)表在了最近的權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然》雜志上。
在這項始于2010年的研究中，密西根大學(xué)的研究人員收集了500名患者的轉(zhuǎn)移腫瘤的樣本，這涵蓋了超過30種不同的癌癥在22種不同器官中的轉(zhuǎn)移。他們提取了這些腫瘤樣本中的DNA和RNA，進行了全外顯子和轉(zhuǎn)錄組測序，并與患者的健康組織進行了對比。
▲項目研究團隊（圖片來源：密西根大學(xué)）
科研人員的第一項發(fā)現(xiàn)并不十分出人意料，轉(zhuǎn)移腫瘤中出現(xiàn)的基因突變的數(shù)量和類型都顯著地多于原發(fā)腫瘤，幾乎每一例轉(zhuǎn)移腫瘤中都含有更多的突變。在轉(zhuǎn)移腫瘤中出現(xiàn)頻率最高的突變都來自于已知的致癌基因，如TP53、CDKN2A、PTEN、PIK3CA、RB1等。這說明了轉(zhuǎn)移腫瘤有更多的時間來發(fā)展新突變，這些新突變可以用來應(yīng)對患者接受的治療，這也就意味著轉(zhuǎn)移腫瘤侵略性更強更難以治療。
通常對于腫瘤的基因組測序都只針對DNA，而這個團隊通過對RNA進行測序，發(fā)現(xiàn)了更多癌細胞如何改變腫瘤微環(huán)境，以及如何通過改變基因表達水平和激活信號通路來促進腫瘤的生長和轉(zhuǎn)移的機制。這些發(fā)現(xiàn)有望幫助找到更多的藥物靶點，此外還能了解癌細胞的免疫特征以預(yù)測患者對于免疫療法的反應(yīng)。對RNA測序帶來的另一項關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)是，轉(zhuǎn)移腫瘤會顯出兩種截然不同的特征之一，它們要么增殖速度非?？欤磿?jīng)歷一個叫做上皮至間質(zhì)轉(zhuǎn)化的去分化過程使它們更容易轉(zhuǎn)向其他器官。
這項研究中最出人意料的發(fā)現(xiàn)是，通過對于腫瘤基因組和正?；蚪M，科研人員發(fā)現(xiàn)有多達12%的轉(zhuǎn)移腫瘤患者攜帶有遺傳的基因突變，這幾乎是所有癌癥患者中帶有遺傳突變的比例的4倍！這些遺傳突變中有大約四分之三的基因與DNA修復(fù)有關(guān)，對于這一機制存在一些靶向療法?？蒲腥藛T建議，這些帶有遺傳突變的轉(zhuǎn)移腫瘤患者的家族成員應(yīng)當(dāng)進行基因組測序和尋求遺傳咨詢，以評估癌癥風(fēng)險。
▲Arul Chinnaiyan博士（圖片來源：密西根大學(xué)）
這項研究的通訊作者、密西根大學(xué)教授、密歇根轉(zhuǎn)化病理學(xué)中心主任Arul Chinnaiyan博士表示：“腫瘤在接受治療后和在轉(zhuǎn)移過程中不斷地進化，因此我們需要對轉(zhuǎn)移腫瘤進行活檢并提出相應(yīng)的治療方法，而不是依靠存檔的原發(fā)腫瘤樣本。”
研究人員表示，初步數(shù)據(jù)顯示他們發(fā)現(xiàn)的基因突變中有75%屬于“可治療的突變”，也就是說已經(jīng)有靶向藥物獲批針對這些突變。下一步他們將繼續(xù)追蹤這些患者接受治療后的療效，以評估對轉(zhuǎn)移腫瘤能否改善患者的預(yù)后。
參考資料：
[1] Gene sequencing of solid tumors sheds light on cancer metastasis
[2] Comprehensive sequencing program shows promise of precision medicine for advanced cancer
[3] Integrative clinical genomics of metastatic cancer
