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              身邊的故事
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              科學家把它們都放進了DNA里(從700k到22M到200M的存儲突破)
              時間:2016-07-13 09:58:24 來源:生物探索 點擊:
               
              導讀
              數據存儲領域的變化催生了一些新的技術,譬如DNA存儲技術。利用DNA存儲數據的思想自“人類基因組計劃”啟動時萌芽,到2012年科學家首次存儲了700k的數據,而后科學家提高到了22M,近日由微軟和華盛頓大學的研究人員創(chuàng)造了新的記錄,他們在比鉛筆芯尖還小的DNA存儲系統(tǒng)里完成了約200MB數據的存儲工作。

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              管底粉紅色物質即DNA,少量DNA即可存儲大量數據

              存儲是信息跨越時間的傳播。數據存儲領域正在發(fā)生著劇烈的變化,并且這種變化將是長期的一種趨勢。隨著數據存儲領域的變化,將催生中一些新的技術改變存儲領域的發(fā)展。

              從20世紀開始,信息技術發(fā)生了歷史性的進步,“萬物皆可數”對人類歷史具有深刻的意義。

              最近,由微軟和華盛頓大學的研究人員創(chuàng)造了新的記錄,他們完成了約200MB數據的保存工作,其中包括《戰(zhàn)爭與和平》(Warand Peace)以及另外99部經典文學作品。

              存儲技術的昨天

               

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              幾千年前的巖畫、古書,以及近代的照相技術、留聲機技術、電影技術以及現代的硬盤光盤、磁盤陣列等技術的發(fā)明,極大豐富了我們的信息獲取渠道。隨著存儲需求量的急劇增加,到2020年,數據有望達到44萬億gigabyte(GB),這已經超出了我們現有的存儲能力,且硬盤和光存儲等DVD和藍光光盤,易受損傷和退化。好消息是,研究人員開發(fā)的DNA存儲技術可以填補這些缺點。

              DNA存儲技術的出現

              你身體里每個細胞的DNA(脫氧核糖核酸)都含有數不勝數的信息量。在科學家完全繪制出基因組圖譜之前,在破解核苷酸的密碼過程中,少數研究者就設想利用DNA進行數據存儲:利用人工合成的DNA(脫氧核糖核酸)作為存儲介質,存儲文本文檔、圖片和聲音文件等數據,隨后完整讀取的技術,具有高效、存儲量大、存儲時間長、易獲取且免維護的優(yōu)點。

              DNA存儲技術的發(fā)展

              DNA是一種令人難以置信的密集存儲介質,每立方毫米(per cubic millimeter.)可以壓縮5.5 petabit(PB,相當于10的15次方個二進制數字,125000 GB)的信息。

              早在2012年,哈佛大學分子生物學家George Church向DNA中寫入了一本5.34 萬個單詞、數據量不到1MB的書,隨后將其印刷在比花粉粒還小的玻璃芯片上。

              2013年,歐洲生物信息學研究所向DNA中寫入了大小為739KB的聲音、圖像和文本以及一個26s的音頻片段存儲了馬汀路德金(Martin Luther King)的《我有一個夢想》(I Have a Dream)的演講稿。

              今年早些時候,哈佛醫(yī)學院和一個技術團隊(George Church也參與)報告稱,已實現了22MB數據的DNA編碼,包括法國無聲電影“月球旅行記”(A Trip to the Moon)。

              2016年7月8日,微軟宣布,利用DNA存儲技術完成約200MB數據的保存,其中包括《戰(zhàn)爭與和平》(Warand Peace)以及另外99部經典文學作品。

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              Luis Ceze語錄

              與此同時,華盛頓大學教授Luis Ceze在鞋盒大小的空間存儲了700 exabyte(EB,相當于1024PB)的數據。Luis Ceze教授還表示,一個鞋盒所放的數據相當于100個大型數據中心的存儲量,可以保留幾千年。此外,他們已經發(fā)現,猛犸象化石在猛犸象死后幾千年仍然含有動物的遺傳密碼子,這說明DNA信息非常耐寒,能夠在殘酷的環(huán)境中存儲數千年。

              DNA是如何存儲信息的?

              DNA存儲技術是一種基于生物分子的數據存儲技術,是以人工合成的DNA(脫氧核糖核酸)分子為存儲介質,以A、C 、G、T這4種堿基對信息進行編碼,將信息存儲于DNA分子中,同時利用現有技術實現DNA分子的復制和DNA分子堿基的修改等操作,從而實現文本文檔、圖片和聲音視頻文件等數據的存儲和讀取。

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              DNA存儲技術的示意圖

              如上圖所示:

              1)首先,研究人員把數據中諸多由“0”和“1”組成的長串轉換為DNA序列的四個基本組成部分:腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。

              2)轉換完成后,研究人員把數據分成段,并且儲存到海量的人工合成的微小DNA分子中,這些分子經脫水可以保存很長時間。

              3)為了便于檢索存儲的數據,研究團隊把類似于郵政編碼和街道地址的信息編入DNA序列,這樣就很容易找到所需數據了。

              4)通過DNA測序技術,研究人員可以“讀取”數據并把它轉換成原始形式,目前科學家已經成功地對圖片數據和視頻數據進行編碼和檢索。

              值得一提的是,盡管DNA存儲技術是可靠的,但如同硬盤驅動器和電子存儲器會發(fā)生錯誤,DNA的寫入和讀取也可能存在錯誤,因此科學家在這一過程中還需要制定糾錯碼,以可靠地檢索數據。

              DNA存儲技術的優(yōu)勢

              相比傳統(tǒng)存儲介質,DNA是一種優(yōu)良存儲介質,能帶來更高的存儲密度和耐久性。DNA存儲技術是一項著眼于未來的具有劃時代意義存儲技術,作為生物分子計算機領域的一個重要分支,它具有存儲密度高、硬件成本低廉、存取高度并行性、擴充性強、儲存長久性等優(yōu)點,極有可能替代傳統(tǒng)的存儲系統(tǒng)。

              微軟首席研究員Karin Strauss表示,由于在數字存儲世界里,通常是以GB或者TB來記錄。雖然200MB聽起來不是很多,但此前并沒有任何研究者能一次性向DNA寫入如此多數據。例如,2012年哈佛遺傳學家George Church將他的電子書存儲到DNA中,只用了700 KB的HTML文本。

              微軟的愿景:盡快降低成本

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              盡管目前還不能使用基于DNA的硬盤存儲假期照片,但這個項目將人類帶入了存儲、處理海量數據的高效時代??茖W家們還嘗試儲存了其他類型的文件,如100多種語言的《世界人權宣言》,《古騰堡計劃》的前100種書籍,作物信托(Crop Trust)的種子庫以及“OK Go's This Too Shall Pass”的高清音樂視頻。

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              Karin Strauss還表示,目前DNA數據存儲一技術實現成本昂貴且操作復雜。微軟希望借助生物科技行業(yè)的研究成果來降低這一技術的最終成本。

              知名市場調研機構IDC預計:科技不斷發(fā)展令數據大量涌現,到明年全球范圍內保存的數字化數據將達到16萬億GB。傳統(tǒng)儲存介質無法滿足龐大的數據存儲需求,DNA作為存儲介質有望解決這一難題,生物芯片存儲企業(yè)迎來發(fā)展機遇。

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