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抗癌藥物的伴隨診斷,NGS伴有何種角色?
時(shí)間:2015-11-18 09:26:03 來(lái)源:生物探索 點(diǎn)擊:

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伴隨診斷(CDx),是指采用體外診斷設(shè)備(試劑)或影像學(xué)工具,為治療性的產(chǎn)品提供安全、有效的指示作用;顯而易見(jiàn)伴隨診斷已經(jīng)成為腫瘤學(xué)家(腫瘤科醫(yī)生)必不可少的工具。根據(jù)分析師的預(yù)測(cè),全球體外診斷市場(chǎng)將從2014年的31.4億美元增加到2019年的87.3億美元。

 

在藥物臨床試驗(yàn)階段,伴隨診斷具有很好的用藥指導(dǎo)作用,一方面可以提高治療的響應(yīng)準(zhǔn)確度;另一方面通過(guò)對(duì)患者的用藥分層預(yù)測(cè)和識(shí)別用藥人群,節(jié)省患者的用藥開(kāi)支。

 

伴隨診斷測(cè)試不僅能夠檢測(cè)到分子靶標(biāo)的存在,還可以監(jiān)視藥物在治療過(guò)程中的脫靶現(xiàn)象,預(yù)測(cè)藥物的不良反應(yīng)及潛在毒性。

 

對(duì)于制藥企業(yè)而言,在藥物開(kāi)發(fā)的過(guò)程中采用伴隨診斷(CDx)可以有效地提高受試藥物在臨床試驗(yàn)中的成功率。

 

研究者分析了1998年到2012年期間的用藥數(shù)據(jù):對(duì)199種獨(dú)特的藥物化合物在676例非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者身上的臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù),并建立了藥物風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)模型。數(shù)據(jù)顯示,在藥物被批準(zhǔn)之前,III臨床試驗(yàn)是藥物研發(fā)中最大的障礙,統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示III試驗(yàn)的成功率僅有28%;然而通過(guò)基于伴隨診斷開(kāi)發(fā)的生物標(biāo)志物指導(dǎo)試驗(yàn),成功率能夠提高到62%。

 

因此,調(diào)查者認(rèn)為,在藥物III臨床試驗(yàn)過(guò)程中采用伴隨診斷,可以有效地提高藥物臨床試驗(yàn)的成功機(jī)會(huì)。

 

監(jiān)管者怎么看?

 

FDA腫瘤科II類治療產(chǎn)品的醫(yī)學(xué)監(jiān)管官Patricia Keegen博士表示,F(xiàn)DA要求新藥在部分特殊性遺傳基因或生物靶標(biāo)上進(jìn)行伴隨診斷,目前只是針對(duì)患有癌癥或某些疾病的患者而不是所有病人都必須采取伴隨診斷。毋庸置疑,伴隨診斷是有益于患者治療,甚至可能監(jiān)控到對(duì)藥物不耐受甚至是副作用的患者,為此FDA將伴隨診斷列為III醫(yī)療器械(最嚴(yán)格的醫(yī)械審核標(biāo)準(zhǔn)),每一款伴隨診斷的試劑在上市前必須經(jīng)過(guò)FDA的PMA(上市前申請(qǐng)?jiān)S可)。

 

2014年8月6日,F(xiàn)DA終于完成了從2011年開(kāi)始修訂的行業(yè)期待已久的《體外伴隨診斷試劑指南》(Guidance for Industry and FDA Staff: In Vitro Companion Diagnostic Devices)。該指南明確規(guī)定:FDA將不再批準(zhǔn)在要求進(jìn)行IVD伴隨診斷情況下,在診斷試劑未被批準(zhǔn)時(shí)或者診斷不合格的治療性產(chǎn)品。

 

藥企和診斷試劑的親密合作將成為FDA批準(zhǔn)“藥企——診斷”產(chǎn)品的關(guān)鍵推動(dòng)力,或者說(shuō)體外診斷公司加入藥企將成為后者產(chǎn)品開(kāi)發(fā)的催化劑。目前全球知名的診斷試劑開(kāi)發(fā)商有羅氏診斷、雅培實(shí)驗(yàn)室、安捷倫公司、凱杰、賽默飛世爾和米利亞德基因公司(Myriad Genetics)。

 

治療方案的選擇

 

然而,目前市場(chǎng)上還沒(méi)有一款基于NGS的用于腫瘤伴隨診斷的試劑。目前市場(chǎng)上所有批準(zhǔn)的測(cè)試皆是基于PCR、免疫組學(xué)、原位雜交等技術(shù)。

 

盡管最近FDA正在考慮是否授予基于Illumina公司的MiSeqDx平臺(tái)進(jìn)行囊性纖維化患者的分型和診斷,但是DAKO的顧問(wèn)Jan Trøst Jørgensen先生在2013年向歐洲生物病理學(xué)會(huì)提議,在采用NGS進(jìn)行靶向抗癌藥物的伴隨診斷前,仍然面臨著許多挑戰(zhàn)。

 

Foundation Medicine公司(FMI)認(rèn)為,基于癌癥基因組特征的方法必須可以幫助醫(yī)生檢測(cè)到病人治療情況,以及具有針對(duì)患者且能夠改善治療的備選個(gè)體化治療方案,否則開(kāi)展伴隨診斷也沒(méi)有什么意義。

 

FMI的首款臨床試驗(yàn)產(chǎn)品是對(duì)整個(gè)編碼區(qū)內(nèi)癌癥相關(guān)的315個(gè)基因和28個(gè)經(jīng)常導(dǎo)致重排或者突變的內(nèi)含子基因進(jìn)行進(jìn)測(cè)序。根據(jù)目前的科學(xué)報(bào)道和臨床文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)上述基因是導(dǎo)致實(shí)體瘤的主要突變基因。

 

TRK融合癌癥

 

2015年7月份,美國(guó)科羅拉多大學(xué)癌癥研究中心和致力于開(kāi)發(fā)高選擇性藥物的生物醫(yī)藥公司Loxo Oncology共同發(fā)布了用于治療有關(guān)TRKA,TRKB或TRKC蛋白質(zhì)的基因的變化的晚期實(shí)體瘤癌癥患者的數(shù)據(jù),描繪了首例采用LOXO-101進(jìn)行I期臨床試驗(yàn)對(duì)原肌球蛋白受體激酶(TRK)的效果反應(yīng)。10月份該公司宣布招募LOXO-101的2期“籃子”臨床試驗(yàn)的第一批受試者,要求受試者為TRK融合的晚期癌癥患者。“籃子”試驗(yàn)是一種新的臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì),招募患者是根據(jù)癌癥的共同的遺傳學(xué)特征,而不是根據(jù)解剖學(xué)特點(diǎn)。

 

LOXO-101是臨床上唯一的選擇性TRK抑制劑。據(jù)了解,LOXO-101的2期臨床試驗(yàn)會(huì)招募TRK融合的8種患者在一個(gè)群組:非小細(xì)胞肺癌,甲狀腺癌,肉瘤,結(jié)直腸癌,唾液腺癌,膽管癌,原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤和所有其他的實(shí)體腫瘤組織。

 

FDA體外診斷和放射衛(wèi)生辦公室主任Elizabeth Mansfield博士在最近的一篇文章中寫道, FDA對(duì)待伴隨診斷的視角也是在不斷進(jìn)化中,表面上看來(lái)許多伴隨診斷的問(wèn)題已經(jīng)得到解決,事實(shí)上隨著人類對(duì)腫瘤生物學(xué)的認(rèn)知和診斷技術(shù)的快速發(fā)展,F(xiàn)DA在判定伴隨診斷方面的思維也面臨不斷刷新的挑戰(zhàn)。不過(guò)毋庸置疑的是,基于NGS測(cè)序的伴隨診斷是未來(lái)趨勢(shì),值得期待。

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