1990年代，與基因組學(xué)相關(guān)的公司相信，通過發(fā)現(xiàn)引發(fā)疾病的基因突變，他們可以發(fā)現(xiàn)更新、更好的藥物靶標(biāo)。其背后的理論認(rèn)為，在患病人群中，高頻率的疾病相關(guān)基因突變使得他們更容易患上某種疾病。由于當(dāng)時基因測序的價格過高，基因組學(xué)相關(guān)公司開發(fā)出了許多聰明的技術(shù)來識別這些有害的基因序列。只可惜他們并沒有發(fā)現(xiàn)更新、更好的藥物靶標(biāo)。
隨著基因測序成本的直線下降，由此而帶來的研究發(fā)現(xiàn)，沒有測序能力與生物信息學(xué)的強(qiáng)大支撐，要在各種突變中找到為數(shù)不多的疾病基因突變談何容易。更復(fù)雜的是，現(xiàn)在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)許多的基因是通過聯(lián)合作用而引發(fā)或阻止疾病的（這是對為什么并非所有攜帶BRCA基因的人都會患乳腺癌或卵巢癌最說得通的解釋）。所以與其大海撈針般去尋找致病基因，這些公司還不如去研究與疾病相關(guān)的基因簇。幸運(yùn)的是，速度更快、價格更便宜的測序設(shè)備的持續(xù)發(fā)展開辟了基因組學(xué)的新的天地。
基因組學(xué)促進(jìn)醫(yī)學(xué)健康發(fā)展
醫(yī)藥領(lǐng)域：基因組學(xué)在醫(yī)藥上的應(yīng)用正在從后往前發(fā)展，而不是曾經(jīng)預(yù)測的那樣從前往后發(fā)展?；蚪M學(xué)在醫(yī)藥上的第一個成果不是來自于前端——靶標(biāo)和藥物研發(fā)——而是來自于后端：疾病分型、臨床試驗(yàn)分層以及促成臨床試驗(yàn)分層的伴隨診斷。我們期待這類工作能夠繼續(xù)發(fā)展并超出腫瘤領(lǐng)域——這是基因組學(xué)影響最大的領(lǐng)域。尋找靶標(biāo)的工作也在進(jìn)行——尤其是在癌癥領(lǐng)域，基于不同腫瘤類型特定分子缺陷，新一代的腫瘤藥物正在研發(fā)中。同樣也期待聯(lián)合應(yīng)用的增加，例如對已失敗的化合物進(jìn)行重新試驗(yàn)，以測試它們在患者亞群中的效用。
診斷領(lǐng)域：基因組學(xué)在產(chǎn)前健康及癌癥的應(yīng)用方面產(chǎn)生的影響最大。在產(chǎn)前健康領(lǐng)域已經(jīng)形成了很大的推動作用，尤其是在染色體異常的無創(chuàng)檢測方面。錢往哪里走，技術(shù)就跟著往哪發(fā)展。因此對保險公司理賠或者將要理賠的項(xiàng)目保持密切關(guān)注，是避免在這個領(lǐng)域中走錯方向的好方法。我們期待產(chǎn)前檢測能夠從染色體異常的檢測擴(kuò)展到基因本身缺陷的檢測以及對準(zhǔn)父母的遺傳疾病基因狀況的檢測。
在腫瘤方面，基于腫瘤中特定遺傳遺傳的診斷方法取代傳統(tǒng)的病理學(xué)技術(shù)帶來了更加有效的治療方案和新靶向化合物的開發(fā)——所謂的精準(zhǔn)用藥——以及對以前的化合物進(jìn)行再次開發(fā)。
疾病預(yù)測：同樣地，基因組學(xué)在癌癥方面的應(yīng)用與分子檢測一道帶來了更加準(zhǔn)確的腫瘤發(fā)展預(yù)測，并形成治療決策。
基因組學(xué)從實(shí)驗(yàn)室到臨床的鴻溝
但是，來自商業(yè)上的消息并不都是積極的，當(dāng)前還存在一些可能會大大阻礙基因組學(xué)促進(jìn)醫(yī)療發(fā)展的問題。隨著科學(xué)上的發(fā)展，從實(shí)驗(yàn)室到臨床的鴻溝不能被忽視。
首先，遺傳信息顯然必須要與臨床結(jié)果相關(guān)。遺傳信息的準(zhǔn)確性在臨床實(shí)驗(yàn)室中是強(qiáng)制，而在科學(xué)實(shí)驗(yàn)室中的要求并沒有這么高。臨床界需要所有的結(jié)果不存在序列錯誤和人為因素，而這兩者都是有可能發(fā)生的。
其次，測序與序列分析需要龐大的數(shù)據(jù)存儲空間與運(yùn)算能力——一個人類基因組的序列數(shù)據(jù)就要占據(jù)3GB的存儲空間，而復(fù)雜的生物信息學(xué)分析程序需要占據(jù)1TB的空間。新的測序技術(shù)中的許多操作參數(shù)本身就是問題的一部分。挑戰(zhàn)還包括了臨床實(shí)驗(yàn)室本身，在那里，設(shè)備與技術(shù)必須能夠接受人為的失誤而產(chǎn)生一致的、且可重復(fù)的結(jié)果。樣品準(zhǔn)備操作指南必須簡單有效且不會耗時太久，設(shè)備的價格加上人工費(fèi)還不能過高。此外，得到結(jié)果所耗費(fèi)的時間必須能夠滿足臨床的需求。更不用說檢測與操作程序指南必須要能通過監(jiān)管要求且無需頻繁更新以免造成繁瑣而昂貴的再次提交。
最后一個問題是則既是一個實(shí)踐問題，也是一個哲學(xué)問題。在地球的數(shù)十億人口中，我們還僅僅對區(qū)區(qū)30000萬左右的人進(jìn)行了基因組測序，這還不足以確定地說哪些遺傳改變——堿基替換、缺失、拷貝數(shù)變異等——是值得采取措施的臨床顯著變化，哪些僅僅是隨機(jī)的突變。這些問題不過是基因組學(xué)上的冰山一角。
VIA：fiercebiotech.com
